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多肽的化學穩(wěn)定性特別依附于氨基酸的組成和序列。凍干多肽往往比溶液中的對應物更穩(wěn)定。下面是多肽的潛在降解方式:
1、水解:
多肽序列中富含Asp(D)十分容易脫水生成環(huán)形酰亞胺中間體。比如,在序列中有Asp-Pro(DP)的前提下,酸催化產生環(huán)狀酰亞胺中間體會造成肽鏈的切割。類似地,在序列上存在Asp-Gly(DG)的情況下,環(huán)形中間體能夠水解成原始的Asp形式(無害)或可能存在的無活性的異天冬氨酸類似物。最后,任何天冬氨酸類型都能夠充分轉化成異天冬氨酸類似物。在較少情況下,包含Ser(S)的序列也能夠生成可以最后切割肽鏈的環(huán)狀酰亞胺中間體。
2、脫酰胺:
在帶有Asn-Gly(NG)或Gln-Gly(QG)的序列中頻頻發(fā)生這類堿催化反應,并按照相當于Asp-Gly(DG)序列的機制。DG序列的脫氨基轉變成環(huán)型酰亞胺中間體,接著水解生成Asn的天冬氨酸或異天冬氨酸類似物。不僅如此,環(huán)狀酰亞胺中間體可引起外消旋化成Asn的D-Asp或D-iso-Asp類似物,這種很有可能是非活性形式。
3、氧化:
Cys和Met殘基是經歷可逆性氧化的重要殘存物。在較高的pH下加快半胱氨酸的氧化,當中硫醇更容易去質子化并且容易形成鏈內或鏈間二硫鍵。通過用二硫蘇糖醇(DTT)或三(2-羧乙基膦)鹽酸鹽(TCEP)處理來逆轉二硫鍵。甲硫氨酸借助化學和光化學反應方式實現(xiàn)氧化,生成甲硫氨酸亞砜,進一步加強進入甲硫氨酸砜,兩者都基本上難以逆轉。
4、二酮哌嗪和焦谷氨酸生成:
當二甲基哌嗪的產生一般發(fā)生于Gly處在N末端的第三位時,尤其是若Pro或Gly位干1或2位。該化學反應涵蓋N末端氮的親核攻擊在第二和第三氨基酸之間的酰胺羰基上,其致使二酮哌嗪模式的前兩個氨基酸的切割。其次,要是Gln在N末端,則焦谷氨酸的產生幾平難以避免。這是相似的反應,其中N-末端氮攻擊Gln的側鏈羰基碳以形成脫氨基的焦谷氨酸多肽衍生物。這樣的轉換也發(fā)生于N-末端帶有Asn的多肽中,不過在較小程度上也發(fā)生。
5、外消旋化:
該名詞被廣泛地應用于指氨基酸或多肽的完好性的整體損失。外消旋化涵蓋將堿性催化的一種對映異構體(通常為L型)的氨基酸轉化為L和D-對映異構體的1:1混合物。這一點在多肽合成的時候較為關注,但成品多肽中存在的問題少些。此外,這類轉化很難被發(fā)覺,無法控制。
避免或最小化多肽降解一般的辦法是將多肽以-20℃或者更首選-80℃的凍干形式貯存。倘若肽在溶液中,則應當通過冷凍每個等分試樣以避免反復凍融。要盡量避免暴露在pH>8??墒牵缧柙?/span>pH>8時溶解多肽,則應把它暴露降到最低,并把冷卻水溶液。最后,將凍干肽和溶液長久暴露在空氣中的氧氣應降到最低。
寫到最后:
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